Ya lo he estado probando y al final he llegado a la conclusion que funciona de la siguiente manera:

1. Coche con baterías cargadas
2. Todo conexionado en el coche pero con el interruptor del variador en posicion "OFF"
3. Manteniendo pulsado el botoncito del cortador de voltaje encender el interruptor del variador (ponerlo en "ON"
4. Se pondra en rojo el led (del cortador de voltaje)
5. Soltar el botoncito del cortador de voltaje.
6. Acelerar a tope hasta que el led verde (del cortador de voltaje) se encienda fijo.
7. Soltar acelerador dejandolo en posicion neutral
8. El led verde parpadeara y despues se pondrá rojo, lo que significa que ya esta programado.

Espero que sirva de ayuda a aquellos que tengan dudas de como programarlo.